GIẢI TRÌNH TỰ VÀ NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM HỆ GEN LỤC LẠP CÂY MÙ U (CALOPHYLLUM INOPHYLLUM L.) Ở TỈNH TRÀ VINH
DOI:
https://doi.org/10.35382/tvujs.14.5.2024.198Từ khóa:
đa dạng di truyền, giải trình tự thế hệ mới, hệ gen lục lạpTóm tắt
SEQUENCING AND CHARACTERIZING THE CHLOROPLAST GENOME OF Calophyllum inophyllum L. AND ITS POTENTIAL FOR SUSTAINABLE AGRICULTURAL DEVELOPMENT
Tóm tắt: Với giá trị thảo dược cao, nhiều sản phẩm được phát triển từ cây mù u như dầu mù u và các loại nguyên liệu mĩ phẩm. Tại tỉnh Trà Vinh, mô hình khai thác và phát triển nguồn gen cây mù u tại xã Mỹ Long Nam, huyện Cầu Ngang đang được triển khai thực hiện và cho thấy tiềm năng phát triển kinh tế. Thông tin hệ gen thực vật, đặc biệt hệ gen lục lạp, là cơ sở phát triển các ứng dụng trong lĩnh vực nông nghiệp như lai tạo giống, các nghiên cứu di truyền, và phát triển chỉ thị phân tử. Trong nghiên cứu này, kĩ thuật giải trình tự thế hệ mới được thực hiện để giải mã trình tự, thành phần gen và đặc điểm cấu trúc của bộ gen lục lạp cây mù u. Kết quả cho thấy, hệ gen lục lạp cây mù u (Calophyllum inophyllum L.) có kích thước là 161.169 bp. Hệ gen lục lạp bao gồm 79 gen mã hóa protein, 30 vùng mã hóa tRNA và bốn vùng mã hóa rRNA. Kết quả này cung cấp thông tin cơ bản cho các nghiên cứu bảo tồn, nghiên cứu đa dạng sinh học và các ứng dụng cơ sở di truyền của cây mù u cũng như các loài liên quan.
Abstract: Due to its high content of medicinal value, many products have been developed from the tamanu tree, such as tamanu oil and various cosmetic raw materials. In Tra Vinh province, a model for exploiting and conserving genetic resources of tamanu is conducted at My Long Nam Ward, Cau Ngang District, and shows potential for economic development. The Chloroplast genome is one of three genomes of plants that exhibit an important role in agriculture, such as breeding, genetic studies, and molecular marker development. In this study, next-generation sequencing technology was used to decode the sequence, gene composition, and structural characteristics of the chloroplast genome of the tamanu tree. Consequently, the complete chloroplast genome of the tamanu tree was 161,169 bp in length. This genome included 79 protein-coding genes, 30 tRNA genes, and four rRNA genes. The results of this study provide essential information for further studies about conservation, biodiversity, and genetic applications of tamanu trees and related species.